MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gordonia polyisoprenivorans VH2 chromosome

Total Repeats: 136790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016906	CGC	2	6	166	171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
2	NC_016906	CAT	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715557
3	NC_016906	CAG	2	6	194	199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
4	NC_016906	CTG	2	6	251	256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
5	NC_016906	CAC	2	6	316	321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
6	NC_016906	GTC	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
7	NC_016906	CGC	2	6	378	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
8	NC_016906	GAG	2	6	386	391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715557
9	NC_016906	ACCCG	2	10	394	403	20 %	0 %	20 %	60 %	378715557
10	NC_016906	ACC	2	6	407	412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
11	NC_016906	TCGG	2	8	416	423	0 %	25 %	50 %	25 %	378715557
12	NC_016906	CCA	2	6	435	440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
13	NC_016906	CA	3	6	458	463	50 %	0 %	0 %	50 %	378715557
14	NC_016906	CGA	2	6	469	474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
15	NC_016906	CGAT	2	8	492	499	25 %	25 %	25 %	25 %	378715557
16	NC_016906	TCCG	2	8	607	614	0 %	25 %	25 %	50 %	378715557
17	NC_016906	TCC	2	6	641	646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
18	NC_016906	GC	3	6	654	659	0 %	0 %	50 %	50 %	378715557
19	NC_016906	GTC	2	6	685	690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
20	NC_016906	CAC	2	6	709	714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715557
21	NC_016906	GCCGTC	2	12	815	826	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	378715557
22	NC_016906	GTT	2	6	856	861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715557
23	NC_016906	GAA	2	6	965	970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715557
24	NC_016906	TCA	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715557
25	NC_016906	CGG	2	6	1007	1012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715557
26	NC_016906	CGC	2	6	1025	1030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
27	NC_016906	TCC	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
28	NC_016906	TCG	2	6	1053	1058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
29	NC_016906	AAGG	2	8	1082	1089	50 %	0 %	50 %	0 %	378715557
30	NC_016906	AGG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715557
31	NC_016906	TTC	2	6	1103	1108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715557
32	NC_016906	AGCA	2	8	1136	1143	50 %	0 %	25 %	25 %	378715557
33	NC_016906	TCC	2	6	1154	1159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715557
34	NC_016906	CGCC	2	8	1163	1170	0 %	0 %	25 %	75 %	378715557
35	NC_016906	GCC	2	6	1240	1245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
36	NC_016906	ACA	2	6	1293	1298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715557
37	NC_016906	CGA	2	6	1309	1314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
38	NC_016906	AAC	2	6	1403	1408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715557
39	NC_016906	CGT	2	6	1435	1440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
40	NC_016906	TGC	2	6	1452	1457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715557
41	NC_016906	GCC	2	6	1484	1489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
42	NC_016906	CCG	2	6	1506	1511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715557
43	NC_016906	CGA	2	6	1531	1536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
44	NC_016906	ACCAC	2	10	1653	1662	40 %	0 %	0 %	60 %	378715557
45	NC_016906	GCG	2	6	1705	1710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715557
46	NC_016906	CCGC	2	8	1740	1747	0 %	0 %	25 %	75 %	378715557
47	NC_016906	AGC	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715557
48	NC_016906	GC	3	6	1756	1761	0 %	0 %	50 %	50 %	378715557
49	NC_016906	CG	4	8	2369	2376	0 %	0 %	50 %	50 %	378715558
50	NC_016906	CCGTC	2	10	2418	2427	0 %	20 %	20 %	60 %	378715558
51	NC_016906	GCCGGT	2	12	2429	2440	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	378715558
52	NC_016906	CGT	2	6	2450	2455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
53	NC_016906	ATCG	2	8	2540	2547	25 %	25 %	25 %	25 %	378715558
54	NC_016906	CCG	2	6	2548	2553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
55	NC_016906	CAA	2	6	2621	2626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715558
56	NC_016906	CGA	2	6	2695	2700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
57	NC_016906	CGC	2	6	2798	2803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
58	NC_016906	GAC	2	6	2811	2816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
59	NC_016906	CGT	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
60	NC_016906	CGC	2	6	2873	2878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
61	NC_016906	CGTG	2	8	2900	2907	0 %	25 %	50 %	25 %	378715558
62	NC_016906	ACG	2	6	3093	3098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
63	NC_016906	GCT	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
64	NC_016906	GCCG	2	8	3140	3147	0 %	0 %	50 %	50 %	378715558
65	NC_016906	CCG	2	6	3154	3159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
66	NC_016906	TGG	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715558
67	NC_016906	TAC	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715558
68	NC_016906	CCG	2	6	3271	3276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715558
69	NC_016906	GCG	2	6	3277	3282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715558
70	NC_016906	CAC	2	6	3413	3418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715558
71	NC_016906	CGG	2	6	3430	3435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715558
72	NC_016906	TGC	2	6	3436	3441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
73	NC_016906	CGA	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715558
74	NC_016906	TCG	2	6	3487	3492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715558
75	NC_016906	TCG	2	6	3705	3710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
76	NC_016906	CAC	2	6	3844	3849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715559
77	NC_016906	GAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
78	NC_016906	CGA	2	6	3919	3924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715559
79	NC_016906	AT	3	6	3964	3969	50 %	50 %	0 %	0 %	378715559
80	NC_016906	GT	3	6	3978	3983	0 %	50 %	50 %	0 %	378715559
81	NC_016906	CGG	2	6	3985	3990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
82	NC_016906	CGG	2	6	4027	4032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
83	NC_016906	GCCGG	2	10	4115	4124	0 %	0 %	60 %	40 %	378715559
84	NC_016906	GCT	2	6	4204	4209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
85	NC_016906	CTG	2	6	4295	4300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715559
86	NC_016906	GC	4	8	4303	4310	0 %	0 %	50 %	50 %	378715559
87	NC_016906	AGG	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
88	NC_016906	ACC	2	6	4349	4354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	378715559
89	NC_016906	GAG	2	6	4382	4387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715559
90	NC_016906	CGG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
91	NC_016906	CGC	2	6	4557	4562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715559
92	NC_016906	CGG	2	6	4572	4577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715559
93	NC_016906	ATC	2	6	4663	4668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715560
94	NC_016906	CGC	2	6	4757	4762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
95	NC_016906	TCG	2	6	4771	4776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715560
96	NC_016906	GCCG	2	8	4813	4820	0 %	0 %	50 %	50 %	378715560
97	NC_016906	CAA	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	378715560
98	NC_016906	CG	3	6	4898	4903	0 %	0 %	50 %	50 %	378715560
99	NC_016906	TCT	2	6	4905	4910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	378715560
100	NC_016906	GC	3	6	4920	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	378715560
101	NC_016906	GTT	2	6	4929	4934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	378715560
102	NC_016906	TCC	2	6	4949	4954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715560
103	NC_016906	TCG	2	6	4988	4993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715560
104	NC_016906	CGC	2	6	5025	5030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
105	NC_016906	GCG	2	6	5100	5105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
106	NC_016906	CGC	2	6	5163	5168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
107	NC_016906	CCG	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
108	NC_016906	GCG	2	6	5242	5247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
109	NC_016906	CGC	2	6	5252	5257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
110	NC_016906	CGA	2	6	5298	5303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
111	NC_016906	TGCC	2	8	5309	5316	0 %	25 %	25 %	50 %	378715560
112	NC_016906	CCG	2	6	5327	5332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
113	NC_016906	GGC	2	6	5349	5354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
114	NC_016906	TGG	2	6	5411	5416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715560
115	NC_016906	GAC	2	6	5428	5433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
116	NC_016906	GCCA	2	8	5473	5480	25 %	0 %	25 %	50 %	378715560
117	NC_016906	TCGC	2	8	5494	5501	0 %	25 %	25 %	50 %	378715560
118	NC_016906	CGA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
119	NC_016906	AGC	2	6	5636	5641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715560
120	NC_016906	ATC	2	6	5644	5649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715560
121	NC_016906	CGG	2	6	5692	5697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715560
122	NC_016906	GGT	2	6	5739	5744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715560
123	NC_016906	CCG	2	6	5860	5865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715560
124	NC_016906	CG	3	6	5964	5969	0 %	0 %	50 %	50 %	378715561
125	NC_016906	GCC	2	6	5997	6002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	378715561
126	NC_016906	GTCG	2	8	6008	6015	0 %	25 %	50 %	25 %	378715561
127	NC_016906	CG	3	6	6024	6029	0 %	0 %	50 %	50 %	378715561
128	NC_016906	CGG	3	9	6039	6047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	378715561
129	NC_016906	GTC	2	6	6067	6072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
130	NC_016906	GGT	2	6	6076	6081	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715561
131	NC_016906	TCCGG	2	10	6087	6096	0 %	20 %	40 %	40 %	378715561
132	NC_016906	TCG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
133	NC_016906	TCG	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
134	NC_016906	GTCAC	2	10	6360	6369	20 %	20 %	20 %	40 %	378715561
135	NC_016906	CGT	2	6	6394	6399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	378715561
136	NC_016906	CGTG	2	8	6419	6426	0 %	25 %	50 %	25 %	378715561
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139	NC_016906	GAA	2	6	6859	6864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715562
140	NC_016906	GAA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	378715562
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142	NC_016906	GGT	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715562
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251	NC_016906	CCGGT	2	10	10878	10887	0 %	20 %	40 %	40 %	378715563
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258	NC_016906	ACCT	2	8	11110	11117	25 %	25 %	0 %	50 %	378715563
259	NC_016906	TGG	2	6	11120	11125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	378715563
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261	NC_016906	GGA	2	6	11160	11165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	378715563
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392	NC_016906	GCA	2	6	17479	17484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	378715571
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498	NC_016906	CTC	2	6	21464	21469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	378715576
499	NC_016906	TCA	2	6	21472	21477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	378715576
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